石墨爐原子吸收分析有關燈電流、光譜通帶及分析線的選擇原則和方法與火焰原子吸收法相同。所不同的是,由于石墨管孔徑小,光損失大;石墨管熱輻射強,通常使用窄光譜帶寬和低光闌;為滿足脈沖信號測量的要求,采用快速響應電路,因此,石墨爐原子化器與光源間的對光調整要比火焰法更為重要,且難度要大些。通常石墨爐的定位程序是,先把石墨爐移開光路不擋光,將元素燈對光調整好,使元素燈透過率調到100%,即吸收值為0。取下石墨爐封閉兩端的石英窗,再把石墨爐放回光路中,上下左右前后調節石墨爐位置,使元素燈的光正好通過石墨爐,透過率為100%或吸收值為0,此時,即認為光路已經調好,再裝上剛才取下的石英窗。
當采用塞曼效應扣背景時,還應了解所選分析線是屬于哪一種塞曼分裂類型,這對于研究干擾、背景校正和原子化機理研究都是重要的。此外,在實驗過程中,要特別注意避免被測痕量組分的損失與玷污,忌用玻璃材質的容器長期存儲標準溶液,注意選用純度符合要求的試劑及實驗室用水,保持實驗室的環境的潔凈等。
石墨爐原子吸收分析步驟有干燥、灰化、原子化程序升溫和采用惰性氣體保護。因此,選擇合適的干燥、灰化、原子化溫度、時間和惰性氣體流量是石墨爐原子吸收分析不可或缺的非常重要的步驟。